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随着国家及社会对高等教育办学要求的不断提高，高校围绕“改善育人环境、提升育人质量、推动学校发展”等方面的工程建设投资不断加大，如何确保有限的建设资金发挥更大的办学效益，如何确保工程建设与廉政建设同步进行，开展工程审计已经成为有效监督手段。
一、审计准备阶段的工作要点（一）建章立制，提升观念。要在认真学习、深入理解上级有关文件精神的基础上，建立符合本校管理特色的建设项目全过程跟踪审计制度，对有关全过程审计内容、审计程序、审计要求等作出明确的规定。并通过向领导层汇报、与工程管理部门沟通、部门宣传等适当形式加大对全过程跟踪审计的宣传，争取得到相关方的理解、配合与支持，尤其工程管理部门要主动适应审计新要求、积极转变思想观念。（二）各负其责，明确分工。由于工程项目建设是一个有多方参与的综合性活动，工作期限长、投入规模大，全过程跟踪审计只有得到各参与方的积极配合、主动接受，才能形成工作合力，项目建设才能顺利进行。在全过程跟踪审计的准备阶段，一定要明确参与方（主要包括内审机构、造价咨询机构、施工单位、监理单位、建设部门）各自的工作职责，以及在全过程跟踪审计中需要履行的义务、配合事项、工作要求等等，尤其是要正确处理好审计部门与工程管理、监理部门的关系和职责，做到履行职责中各负其责。（三）选好队伍，严格管理。高校在前期调研、招标过程中一定要严格把关、选好队伍，并制定规范、全面的审计方案，规范工作流程，明确工作要求和标准，为开展全过程跟踪审计业务奠定基础。同时，高校内审机构也要加强对聘用审计人员的严格管理和纪律要求，加强过程管控，严禁审计人员与施工单位人员直接接触，确保审计结论的客观、公正。二、项目建设前期的审计要点（一）可行性研究阶段的审计。可行性研究是建设工程投资前期工作的核心和重点，也是项目决策的重要依据。这一环节的审计要点包括：项目建议书的内容是否实事求是，客观真实;对拟建项目的分析、调研是否全面准确，经济上是否可行，资金来源是否可靠，环保是否符合要求;有关专家的意见是否客观、真实，不同意见是否得到重视;项目论证是否有多方案的比较和对比，拟定方案是否科学、最优。（二）项目设计阶段的审计。这一阶段的审计要点：项目选址及建设规模是否科学，是否符合单位财力;设计方案中有关项目的经济效益、环境效益及社会效益是否客观、合理;施工图的设计是否满足施工需要，是否能够确保项目落地生根;有关方案、设计费用的计算是否合规合理等。三、项目实施准备阶段审计要点（一）招投标审计。主要审计要点：一是加强对工程量清单的审查与核对，重点审查清单内容有无缺项、漏项、重复计量以及不合理计量的情况;二是审查工程最高限价的计算是否合理，有关定额套用、材料价、规费的计取等是否规范、准确;三是对工程招标文件进行审核，重点审查招标文件的招标范围、投标资质、评标办法以及招标程序等是否合理、合规，有无“倾向性、特定性”等不公平条款;四是对投标文件进行審核，重点审查商务标是否存在“不平衡报价”情况，避免出现“低价中标、高价结算”审计风险。（二）施工合同审计。主要审计要点：一是对合同的合法性审核，确保合同的内容、文本格式与现行的有关法律法规、政策和招标文件相符，主要合同条款是否与招标文件、现场澄清文件、中标价格、工期、质保期及其他服务承诺一致;二是对合同的合理性审核，包括合同有关条款的描述和意思表达是否清楚、准确，是否会产生歧义，工程价款的金额是否准确，有关工程费用的支付、结算等是否符合现行的基建财务制度、工程计价规则等规定，有关合同审批手续是否完善;三是对合同完整性的审核，主要审查合同约束条款是否完善，有无遗漏，有关合同附件、附表是否齐全，对补充事项的约定是否完整、满足要求，对争议事项的处理是否有明确的约定;四是对合同专业性的审核，主要审核涉及合同变更的条款是否完整、具体、符合工程计价规范，如合同外增加的材料单价如何确定，材料价格发生变化后如何处理，有关误工索赔、工期索赔是否有明确约定等等。（三）项目法人内控制度建立情况审计。主要审查项目单位是否建立健全了相关的内控制度，有无规范的管理流程和审批程序，关键岗位及人员设置是否到位，有关管理制度是否齐全，如设备采购、工程签证、物资验收、工程例会以及人员考勤、管理、奖惩、门禁等。
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